版权登记有利于保障商标权利的稳定，防止只注册商标导致的权利缺失。
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当商标的设计者和商标注册人为同一人的时候，从法律上讲，是不会产生权利冲突的，但如果二者非同一个人，或者两者为同一人但是无法证明的时候，权利冲突就产生了，这种情况下，商标的注册很可能会受到影响。因为一件委托作品，或是职务作品，没有进行版权登记则难以证明其归属权，无法确定原始权利，就会给权利人主张权利造成极大的困难。而版权登记很好的解决了这一问题，因为除非有其他足以推翻著作权登记证书内容的相反证据，否则，持有登记证书的一方将被司法机关或行政机关认定是作品的著作权权利人。

根据《商标法》的有关规定，如果著作权利人对注册商标有异议的可以向商标评审委员会申请撤销该注册商标，也可以请求法院判令商标权人停止使用其注册商标。

所以如果版权归属不明，商标在注册过程中可能会遇到商标作品的版权之争。也就是说，当商标在申请注册过程中，若商标设计者主张该商标的著作权属于他本人，而商标申请人又无法拿出相应的证据材料，就会产生麻烦。而到目前为止，只有对商标进行版权登记才是最有效也最便捷的规避方式。将原创的图形申请商标的同时进行版权登记，可以保证该商标的著作权和商标权都属于自己，在这种情况下，是没有人能够与你发生版权归属之争的。

此外，有些人觉得，作品自完成之日起就拥有著作权，既然都拥有了，还登记干什么？虽然版权自带保护功能，但这种保护在需要提供证据确权时是无法起到作用的，这也正是它的弊端所在。为了对我们的版权进行保护，最好的方式还是要进行版权登记，特别是商标，先做版权登记的，能够在后续注册过程中避免很多问题。